ارتباطات نزدیک آیت الله مصباح با سرداران و رهبران مقاومت، وی را به یکی از چهره های تعیین کننده در مسائل منطقه ای تبدیل کرده است. نقش استاد مصباح در پشتیبانی از محور مقاومت، در سه سطح قابل تبیین است. نخست در سطح تقویت مبانی فکری نیروهای مقاومت؛ سطح دوم، در حمایت معنوی و روحی سرداران، رزمندگان و خانواده های شهدای مقاومت و سطح سوم در حمایت میدانی از مقاومت.
آیت الله مصباح در پشتیبانی فکری از جبهه مقاومت، اقدامات چشمگیری مانند برگزاری دوره طرح ولایت به زبان عربی برای نیروهای حزب الله لبنان، اجرای طرح منسجم و نظام واره طرح ولایت برای این حزب، خط دهی به روحانيون سپاه قدس، تبیین دستاورردهای مقاومت در منطقه و جهان، و تربیت شاگردانی آگاه به مسائل صهیونیستم جهانی، بخشی از فعالیت های علمی ایشان است. ارتباط فکری حزب الله لبنان با استاد مصباح به حدی بود که هر گاه افراد اثرگذاری از این حزب به ایران سفر می کردند، یکی از ماموریت های اصلی خود را دیدار با علامه تعریف می کردند. دیدار اخیر سید صفی الدین با استاد مصباح در همین راستا قابل تحلیل است.
نوع تبیین استاد از وقایع منطقه، افق های جدیدی را پیش روی مجاهدان قرار می داد. استاد مصباح حمایت های مستشاری ایران از محور مقاومت در منطقه را در راستای دفاع از اسلام و بیداری و مقاومت مسلمانان منطقه می دانستند. وی درباره نقش سوریه در ماجرای داعش می گوید: «مسأله سوریه، مسأله حکومت سوریه نیست؛ بلکه مسأله این است که...تنها حلقه واسطه برای کمک رساندن به دو کشور لبنان و فلسطین، سوریه است حمایت ایران از دولت سوریه وسیلهای است که بتواند برای اسلام خدمت کند، حرکت مقاومت را در عالم زنده کند.» توجه استاد مصباح به تقویت مبانی دینی نیروهای مقاومت، از وی مجتهدی توانمند و تئوریسینی دارای فهم بالا از تحولات منطقه ای ساخته بود.
حمایت معنوی آیت الله مصباح از محور مقاومت را می توان در قالب دلجویی ها و دیدارهای مکرر ایشان با بیت شیخ زکزاکی، بانوان شيعه كويت و خانواده عماد مغنیه شاهد بود. دیدارهای وی با سیدحسن نصرالله، شیخ نعیم قاسم، و ارتباطات ایشان با سردار دلها شهید قاسم سلیمانی در این زمینه قابل توجه هستند. تمجید از رشادت ها و ایثارگری های حزب الله لبنان، بخشی از حمایت معنوی را شامل می شوند. آیت الله مصباح یزدی در جمع دانش آموزان و جوانان نخبه فرمودند: حزب الله یکی از شاخه های درخت پرثمر انقلاب است. سید حسن نصرالله که یکی از معروف ترین و محبوب ترین شخصیت های جهان عرب و جهان اسلام است»
استاد در دیدار با شیخ نعیم قاسم، قائم مقام دبیرکل حزب الله لبنان فرمودند: یکی از نعمت های الهی برای ما، وجود مقام معظم رهبری است؛ در طول تاریخ، کمتر شاهد چنین نعمتی بودهایم. در مرتبه بعد از رهبری نیز کمتر کسی را مانند جناب سید حسن نصرالله با این متانت، شجاعت و صفات ممتاز میتوان یافت؛ ایشان نعمتی بزرگ در لبنان است. باید خدا را به خاطر وجود چنین نعمتهایی شکرگزار باشیم و برای سلامتی ایشان، دعا کنیم.
آیت الله مصباح در دیدار با اعضای خانواده شهید عماد مغنیه فرمودند: هر چند با شهادت ایشان، نعمت عظیمی از دست رفت، اما این شهادت، چنان برکاتی داشت که مصیبت فقدان ایشان را کاملا جبران کرد. شهادت ایشان برکاتی برای حزب الله داشت که چنین برکاتی، جز با شهادت ایشان متصور نبود. پیروزی های حزب الله بعد از شهادت ایشان، در واقع از برکات شهادت ايشان است.(29 اردیبهشت 93)
بخش دیگری از حمایت های استاد مصباح، در قالب حمایت های میدانی از محور مقاومت ظهور و بروز داشت. اعزام مستمر بخشی از شاگردان به سوریه و تقدیم چهار شهید مدافع حرم از موسسه تحت مدیریت استاد مصباح، نشان دهنده اهتمام ایشان نسبت به مقاومت است. ارتباطات ایشان با سردار دلها شهید حاج قاسم سلیمانی به گونه ای بوده که سردار شهید، انگشتر خود را به یکی از نزدیکان علامه می دهد و می گوید سلام بنده را به آیت الله مصباح برسانید و این انگشتر را از طرف بنده به ایشان هدیه کنید. مقبولیت استاد در میان سران مقاومت به حدی است که رهبر شیعیان بحرین، آیت الله شیخ عیسی قاسم درباره وی می گوید : دین اسلام دارای مردان و ستون های بزرگی است که آیت الله مصباح از جمله آنهاست.