مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: با این که روایان حضرت زهرا (سلام الله علیها) کمتر از بقیه ی معصومین (علیهم السلام) است، ولی فاطمه ی زهرا (علیهاالسلام) صاحب مصحف است و همان روایات کم که از ایشان رسیده بسیار پر اهمیت است.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: این که در زمان غیبت به خواندن دعای اللهم عرفنی نفسک سفارش شده است، ظاهراً سری دارد. هم چنین سفارش شده است که این دعا نیز خوانده شود: یالله یا رحمان یا رحیم، یا مقلب القلوب، ثبت قلبی علی دینک.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: خدا چه صبری داده به حضرت غایب (عجل الله تعالی فرجه الشریف) که هزار سال است می بیند بر سر مسلمان ها چه بلاهایی می آید و چه بلاهایی خود مسلمانان بر سر هم می آورند، و همه را تحمل می کند!
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: وای بر ما اگر روزی بیاید که اسرار پنهان ما زیرو رو شود و معلوم گردد که از اهل علم و اهل دین نیستیم، و تنها دنیای خود را آباد کرده ایم، و با این لباس به صورت غیر مستقیم سبب انحراف دیگران شده ایم.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود:عامه در نگهداری و چاپ و نشر کتابهای بزرگان خود بر ما مقدم هستند. تعداد کتابهای تالف و غیر تالف، و مطبوع و غیر مطبوع ما و آنها را به صورت درصد نوشتهاند که ما با آنها قابل مقایسه نیستیم، ولی اهمیت نمیدهیم.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: حضرت عیسی (علیه السلام) از احمق یعنی کسی که نمی فهمد و نمی فهمد که نمی فهمد، فرار می کرد. ما خرابیم، خدا کند بفهمیم که خرابیم، تا به فکر اصلاح و درمان برآییم.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: قرآن کتابی است که پیغمبر ساز است؛ زیرا پیغمبران دو گونه اند:پیامبرانی هستند که از جانب خداوند به پیامبری تعیین شده اند و پیغمبران کمالی، که در اثر ایمان و عمل به دستورات قرآن، به کمالات پیامبر نایل می گردند.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: چه مصائبی بر امام زمان (عجل الله تعالی فرجه الشریف) که مالک همه ی کره ی زمین است و تمام امور به دست او انجام می گردد، وارد می شود، و آن حضرت در چه حالی است و ما در چه حالی؟
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: اگر کسی بخواهد عبادت کند و به خدا ایمان داشته باشد، یا ایمانش محفوظ بماند، و این امر متوقف بر نقل سکنی از آن بلاد به بلاد اهل ایمان باشد و منتقل شدن از آنجا برای او ممکن باشد، باید مهاجرت کند.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: تنها انتظار فرج کافی نیست؛ تهیأ، بلکه طاعت و بندگی نیز لازم است، مخصوصاً با توجه به قضایایی که پیش از ظهور امام زمان (عجل الله تعالی فرجه الشریف) واقع می شود.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: این همه بلاها که بر سر ما می آید، با دست خودمان به وجود آمده است و علت و سببش خود ما هستیم. خودمان نیزه به پهلوی خود می زنیم و آخ می گوییم و سپس از دست خود فغان و ناله می کنیم.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: سوال شد؛ دلیل بر این که علی پیشوای همگان در تمام مسایل است، چیست؟ پاسخ دادند؛احتیاج همه (صحابه) به او در تمام مسایل، و بی نیازی او از همگان در همه ی مسایل، دلیل بر این است که او امام و پیشوای همه است.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود:قرآن، کتابی نیست که کسی بتواند نظیرش را بیاورد. ببیند و قضاوت کنید. می ببیند و می دانند که عاجز از آن هستند و نمی توانند مانند آن را بیاورند، ولی باز هم به آن ایمان نمی آورند!
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: قاعدتا حفظ قرآن خیلی آسان است و تکرار هم لازم ندارد؛ سهل الله حفظه لامته (صلی الله علیه و آله و سلم) خداوند، حفظ آن را بر امت رسول خدا (صلی الله علیه و آله و سلم) آسان نموده است.
آیت الله العظمی بهجت می فرمود: شخصی می گفت: در عرض دو یا سه ماه، دو ختم یا سه بار به صورت عادی قرآن را ختم نمودم و دیدم که حافظ کل قرآن هستم. حتی به قصد حفظ هم نخوانده بودم.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: اگر چشم بصیرت داشتیم، سخن خدای متعال را که میفرماید: و لو ان قرءانا سیرت به الجبال او قطعت به الارض او کلم به الموتی را قدر میدانستیم.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: اگر به قرآن عمل می کردیم، دیگران را به اسلام و قرآن جذب می نمودیم، زیرا قرآن جامع کمالات همه ی انبیای اولوالعزم (علیهم السلام) است.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: خدا می داند صد سال قبل چه رجال برجسته ای در حوزه های علمیه ی اصفهان، تبریز، و... بودند. از اطراف به آن جاها می آمدند و در درجات علمی و عملی کامل می شدند.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: مراجعه به تراجم علمای سلف به منزله ی مراجعه به کتاب های معتبر اخلاقی است. هر کس که طالب تهذیب و ترقی در امور معنوی است و می خواهد از زندگی و عمر خود چیزی استفاده کند، شایسته است به شرح احوال آنها نگاه کند.
مرحوم حضرت آیت الله العظمی بهجت می فرمود: امام زمان(عج) ر مسجد سهله، جمکران، در خواب و بیداری در گوش افرادی از دوستانش بدون این که او را ببینند، فرموده است: فرج من نزدیک است، دعا کنید. یا به نقلی فرموده: فرجم نزدیک شده، دعا کنید بدا حاصل نشود.